A szervezet 2008. április 10-től folytat nyomozást a MÁV ÁBE működésével kapcsolatban sikkasztás, csalás, hűtlen kezelés, pénzmosás, számvitel rendjének megsértése és magán-okirathamisítás bűncselekmények elkövetésnek megalapozott gyanúja miatt az egyesület egykori elnöke és társaival szemben.
Az eljárás során a nyomozó hatóság kezdeményezése alapján az egyesület korábbi elnökének előzetes letartóztatását 2008. október 13. napjáig meghosszabbították. További két személlyel szemben lakhelyelhagyási tilalmat rendelt el az illetékes bíróság.
A folyamatban lévő nyomozás során biztosítási intézkedésként lefoglalt pénzösszegből a MÁV ÁBE tulajdonát képező 666 millió forintot a vámhatóság felszabadított és ezt augusztus 13-án visszautalta az egyesületnek.
Az okozott kár megtérülése érdekében a vám- és pénzügyőrség a már átutalt összegen felül további 1 milliárd forintot meghaladó vagyont biztosított.
